프로그램이 자기 자신을 죽이는 방법은 별로 추천하고 싶지 않습니다.

업데이트를 담당하는 프로그램을 하나더 만드셔야 할 것 같습니다.
그러니까 메인 프로그램( Main P/G ) 하나와 업데이트 프로그램( Update P/G )를
별도로 만드시고

1. Main P/G 에 있는 Update 단추가 눌러지면 ShellExecute( Update P/G ) 와 같이
   프로그램을 실행합니다.

   이 때 파라메터로 Main P/G의 Windows Handle을 같이 넘깁니다.

2. 호출받은 Update P/G는 약간의 대기시간( 약 0.5초 정도 ) 후에 전달받은 Windows
   Handle의 Main P/G에 실행 종료 메시지를 전달합니다.

3. Update P/G가 remote로 부터 데이타를 전송 받습니다.

4. 모두 전송받은 후에 ShellExecute( Main P/G ) 와 같은 방법으로 메인 프로그램을
   실행 시킵니다.

Update P/G를 종료하기 위해서는 Main P/G를 호출할 때 특수한 인자를 전달하거나
Main P/G 자신이 Update P/G가 현재 시스템에 있는지 확인해서 종료 메시지를 전달
할 수 있습니다.

도움이 되셨나요?
더 궁금한게 있음 다시 질문하십시요.